Kariyerine 2006 yılında Samsunspor altyapısında başlayan Doğan, 2012-13 sezonu öncesi Erhan Altın tarafından a2 takımdan ilk takıma alınmış ve 24 Ağustos 2012 tarihinde kulübüyle profesyonel sözleşme imzalamıştır. Profesyonel kariyerinin ilk maçına ise 23 Aralık 2012 tarihindeki 1. Lig karşılaşmasında Adana Demirspor karşısında çıkmıştır.[1] Erdoğan, bu maçla birlikte Türkiye liglerinde forma giyen en genç futbolcu unvanını kazanmıştır. Fakat bu unvan 3 Mart 2013 tarihinde yine bir Samsunsporlu olan Kemal Sabri Bayraktar tarafından ele geçirilmiştir.